В собрание музея вошла коллекция произведений ведущего стекольного предприятия Советского Союза Ленинградского завода художественного стекла, которое в 1996 году было закрыто. Коллекция заводского музея насчитывала около семи тысяч предметов и была спасена от разорения и продажи благодаря Главному художнику завода Н. М. Гончаровой, Комитету по управлению городским имуществом, Комитету государского контроля, охраны и использования памятников истории и культуры, а также сотрудникам Елагиноостровского дворца‑музея. В 2000 году коллекцию разместили в фондохранилище Кухонного корпуса.